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預防接種政策，使台灣遠離了傳染病肆虐的威脅。李慶雲積極研發疫苗並協助政府推動孩童打預防針，50年來，天花、白喉、小兒麻痺在台灣銷聲匿跡，日本腦炎、麻疹獲得控制，也奠定台灣感染症醫學的基礎。

疫苗安全嗎？李慶雲的小孩先打疫苗做示範

在台灣的醫療體制裡，感染科屬於二線單位，患者大多是轉診或會診，因此編制最少，也較不受重視，但幸虧這群躲在幕後的小兒感染科醫生們勇敢堅持，從預防、治療到研究，為台灣防疫史寫下漂亮的戰績。

譬如宣導預防接種曾倍受阻撓。50多年前台灣麻疹流行，疫苗之父李慶雲教授的大女兒因感染麻疹發高燒抽筋，差點送命，因此他努力研發出麻疹和日本腦炎疫苗。為了讓人相信疫苗是有效安全的，他讓自己年幼的二個女兒和兒子率先接種疫苗，並選在台大醫院大廳公開接種以取信於人。

1981年，B型肝炎疫苗剛研發成功，李慶雲認為新生兒應該普遍施打，可有效遏止肝癌發生率，但當時找不到醫院願意配合做人體試驗，李慶雲請學生黃富源幫忙，當年還是台北馬偕小兒科醫師的黃富源看到疫苗安全性報告，以及高達百萬的鉅額賠償金後認為，「他們一定是對這疫苗很放心才敢這麼做，」他自告奮勇由馬偕醫院接下人體試驗，經過一年測試，疫苗成功獲得肯定，政府大力支持B肝研究計劃，開啟了台灣享譽世界的肝炎防治研究。

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